Identification of immunodominant Bartonella bacilliformis proteins: a combined in-silico and serology approach.

BACKGROUND: Bartonella bacilliformis is the aetiological agent of Carrión's disease, a biphasic and highly lethal illness formerly restricted to the South American Andes that is now spreading to adjacent areas. Reliable serodiagnostic approaches and vaccines are urgently needed. In this study, we aimed to identify immunodominant proteins of B bacilliformis and to establish novel and reliable serodiagnostic tools. METHODS: We used a reverse vaccinology approach in combination with an analysis of heterologous genomic expression libraries to identify immunodominant proteins, on the basis of the genome sequences of B bacilliformis strains KC583 and KC584. Antigens were screened with serum samples collected from Peruvian patients with B bacilliformis infections and from German healthy blood donors without history of travel to South America. We further analysed immunoreactive proteins of B bacilliformis with immunoblotting and line blots. We used selected target proteins to develop a diagnostic ELISA. To assess the performance of this ELISA, we did receiver operating characteristic analyses to assess the area under the curve, cutoff values, sensitivities, and specificities with 95% CIs. FINDINGS: We used serum samples obtained between Dec 23, 1990, and May 5, 2018, from 26 Peruvian patients with B bacilliformis infections and serum samples taken between Aug 28 and Aug 31, 2020, from 96 healthy German blood donors. 21 potentially immunodominant proteins were identified and recombinantly expressed, and their reactivity was assessed with immunoblotting and line blots. Of these 21 antigens, 14 were found to be immunoreactive. By using serum samples of Peruvian patients with Carrión's disease and of healthy German blood donors, we identified three antigens (porin B, autotransporter E, and hypothetical protein B) as suitable immunodominant antigens, and we applied them in a diagnostic ELISA using two different antigen combinations (porin B plus autotransporter E and porin B plus autotransporter E plus hypothetical protein B). For the combination of porin B and autotransporter E, with optical density measured at 450 nm (OD450) cutoff value of 0·29, sensitivity was 80·8% (95% CI 60·7-93·5) and specificity was 94·8% (88·3-98·3) for all Peruvian patient samples. For a combination of porin B, autotransporter E, and hypothetical protein B, with an OD450 cutoff of 0·34, sensitivity was 76·9% (56·4-91·0) and specificity was 93·8% (86·9-97·7) for all Peruvian patient samples. INTERPRETATION: This novel ELISA could represent a useful serodiagnostic tool for future epidemiological studies of B bacilliformis in endemic areas. Additionally, the immunodominant antigens we have identified could provide a first basis for future vaccine development to prevent the highly lethal Carrión's disease. FUNDING: DRUID (Novel Drug Targets against Poverty-Related and Neglected Tropical Infectious Diseases) Initiative and Robert Koch Institute. TRANSLATIONS: For the Spanish and Quechua translations of the abstract see Supplementary Materials section.

Resistencia a clindamicina inducida por eritromicina en Staphylococcus aureusaislados de tres hospitales de Lima, Perú / Erythromycin induction of clindamycin resistance in Staphylococcus aureus isolated from three hospitals in Lima, Peru

Introducción: Staphylococcus aureus es un importante patógeno involucrado en una serie de infecciones cuyo impacto se incrementa por sus múltiples factores de virulencia y su resistencia a los antimicrobianos. La resistencia a clindamicina inducida por eritromicina constituye un problema creciente en diversas partes del mundo. Objetivos: determinar la frecuencia de resistencia a clindamicina inducida por eritromicina en Staphylococcus aureus aislados de 3 hospitales de Lima Metropolitana, la presencia de de cepas SAMR MLSBi y su relación con el origen biológico de las cepas. Material y método: entre mayo del 2005 y septiembre del 2006, se estudiaron 272 cepas de Staphylococcus aureus procedentes del Hospital Nacional Cayetano Heredia, Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas e Instituto Nacional de Salud del Niño. Se determinó la resistencia a meticilina por el método Oxacillin Agar Screen, y la resistencia inducida a clindamicina usando el ensayo de inhibición por doble disco difusión en agar (D-Test). Se determinaron los fenotipos de MLSBi Resultados: se detectaron 13 cepas D-test positivo, de las cuales 9 (3,3 por ciento) fueron SAMS y 4 cepas fueron SAMR (1,5 por ciento). La resistencia total a clindamicina (constitutiva e inducida) representa el 48,2 por ciento del total de cepas evaluadas. Conclusiones: la frecuencia de resistencia inducida a clindamicina en cepas de Staphylococcus aureus nuestro país es aún baja tanto en cepas sensibles como resistentes a meticilina.

Background: Staphylococcus aureus is an important pathogen involved in many infections, and it has a greater impact because of its many virulence factors and antimicrobial resistance. Erythromycin-induced clindamycin resistance in S. aureus is an increasing problem in different parts of the world. Objectives: To determine the frequency of Erythromycin-induced clindamycin resistance in S. aureus isolates from three hospitals in Lima, Peru. To determine the presence of MRSA-MLSBi among these strains and their relationship with the biological origin of the resistant strains. Material and methods: 272 Staphyloccus aureus strains were isolated in Cayetano Heredia National Hospital, The National Institute for Cancer, and The Children National Health Institute between May 2005 and September 2006. Resistance to methycillin resistance was determined using the Oxacillin Agar Screen, and erythromycin-induced clindamycin resistance was assessed using the dual-disc agar diffusion methods (D-test). MLSBi phenotypes were also identified. Results: We found 13 D-test positive S. aureus strains, 9 (3.3 per cent) of them were MSSA and 4 were MRSA (1.5 per cent). Total resistance to clindamicyn (constitutive and inductive) was found in 48.2 per cent of the total strains tested. Conclusion: The frequency of Erythromycin-induced clindamycin resistance in S. aureus strains in our country is still low in both methycillin-susceptible and methycillin-resistant strains.

Colonización vaginal y anorectal por Streptococcus agalactiae en gestantes de los Hospitales Nacionales Cayetano Heredia y Arzobispo Loayza / Vaginal and anorectal colonization by Sterptococcus agalactiae among pregnant patients from Cayetano Heredia and Arzobispo Loayza Hospitals

Objetivo: Considerando la importancia del Streptococcus agalactiae en infecciones en neonatos y puérperas y la ausencia de información sobre su prevalencia en nuestro medio, se realizó el presente estudio con el objetivo de determinar los niveles de colonización en secreciones vaginales y anorrectales de mujeres embarazadas en dos importantes centros hospitalarios de la ciudad de Lima. Materiales y métodos: Entre los meses de abril a octubre del 2002, se estudiaron 238 gestantes con 26 semanas o más de gestación que acudieron al consultorio externo del servicio de Obstetricia de los Hospitales Nacionales Arzobispo Loayza y Cayetano Heredia; mediante hisopados se obtuvieron muestras de secreción vaginal y anorrectal empleando como medio de enriquecimiento selectivo caldo Todd Hewitt suplementado con gentamicina (0.8 mg/mL) y ácido nalidíxico (15 mg/ml). El cultivo se realizó en agar sangre de carnero al 5 por ciento, identificándose el germen mediante el tipo de hemólisis, la prueba de CAMP, bacitracina y sulfametoxaxol / Trimetoprim. Resultados: Se logró aislar Streptococcus agalactiae en 26 pacientes (10.9 por ciento). No se encontró asociación con tiempo de gestación, edad materna ni número de partos. De las 26 gestantes colonizadas por Streptococcus agalactiae, 09 (36.4 por ciento) manifestaron haber presentado abortos previos. Las pacientes con cultivos positivos recibieron tratamiento quimioprofiláctico. Conclusiones: Los resultados obtenidos en el presente estudio, muestran la necesidad de realizar trabajos de investigación que identifiquen la magnitud del problema en Lima y el interior del país a fin de orientar la implementación de las medidas preventivas necesarias.

Carbunco cutáneo y compromiso meningoencefálico: Estudio clínico epidemiológico de 68 casos en Lima / Cutaneous carbuncle and menigoencephalic pledge: Epidemiologic clinic study of 68 cases in Lima

Durante el período de 1969 a 1987 se tuvo 68 casos (46 varones y 22 mujeres) con el diagnóstico de carbunco cutáneo. Cuatro de ellos presentaron como complicación asociada compromiso menmingoencefálico. La mayor frecuencia de casos (26/68) se registró entre 1977 a 1980, siendo los meses de enero a mayo los de mayor frecuencia (42/68). La población afectada estuvo comprendida entre 30 a 49 años (43/68), la ocupación que tuvo una mayor asociación con la enfermedad fue la agricultura (25/68). Los casos se agruparon en: diagnóstico definido (30/68) cuando se identificó al bacilo y de diagnóstico probable (38/68) cuando se tuvo el antecedente y cuadro clínico compatible. De los signos, destacaron: úlcera con necrosis central (97,1 por ciento), umbilicación (94,1 por ciento), eritema perilesional (72,1), edema (88,1 por ciento) y ganglio regional doloroso (64,1 por ciento). Los pacientes más comprometidos presentaron fiebre, compromiso del sensorio (7,4 por ciento) y signos neurológicos (5,9 por ciento). Las lesiones se distribuyeron con mayor frecuencia en los miembros superiores y en número preferentemente múltiples (66,2 por ciento). La evolución con tratamiento antibiótico fue favorable, de respuesta rápida en los casos de carbunco cutáneo sin complicaciones, favorable de respuesta lenta en los casos que hubo celulitis asociada y desfavorable en los casos de compromiso meningoencefálico. La mortalidad observada fue de 4,4 por ciento y en los casos de meningoencefalitis carbonosa llegó al 75 por ciento.

Carbunco cutáneo en el Perú: revisión y experiencia / Cutaneous Carbuncle in Peru: review and experience

Entre 1969-1987 estudiamos 68 casos de carbunco cutáneo, cuatro de los cuales presentaron una severa complicación meningoencefálica. El promedio de edad fue de 37 años (rango:8-67). La ocupación predominante fue de 36,8 por ciento de agricultores, 25 por ciento ganaderos y 14,7 por ciento carniceros. La mayoría procedió de la provincia de Lima (92,6 por ciento) siendo el mayor número de casos de los distritos de Puente Piedra y San Martín de Porres. De los signos clínicos locales destacan: presencia de úlcera cutánea con necrosis central y/o costra central 97,1 por ciento, úlcera umbilicada 94,1 por ciento, eritema perilesional 72,1 por ciento, ganglio regional doloroso 63,1 por ciento, edema localizado 60,2 por ciento, rodete perilesional 39,7 por ciento y sólo un 20,6 por ciento secreción purulenta. Las lesiones fueron únicas en el 33,8 por ciento y el resto dobles o triples. El frotis de la úlcera fue el examen con más eficacia 67 por ciento, seguido de cultivo de úlcera con 32 por ciento. Se tuvo además otros síntomas, así la fiebre se presentó en 67,1 por ciento, malestar general 50 por ciento; cuatro pacientes presentaron convulsiones. El LCR de estos cuatro pacientes fue del tipo purulento. El tratamiento más empleado fue la penicilina 66,2 por ciento, Penicilina G sódica en forma parenteral se administró de 6 a 12 millones por día a los pacientes complicados con meningoencefalitis. La evolución clínica fue favorable en la mayoría de los pacientes sin celulitis y en trece pacientes que tuvieron además celulitis sobreagregada, la respuesta clínica fue más lenta. Tres de los cuatro pacientes complicados con meningoencefalitis fallecieron antes de las 72 horas después del ingreso. La mortalidad general de nuestra serie fue de 4,41 por ciento.

Primer reporte de bartonella henselae y bartonella clarridgeiae en pacientes con enfermedad del arañazo de gato y angiomatosis bacilar en Lima / First report of bartonella henselae and bartonella clarridgeiae in patients with cat scratch disease and bacillary angiomatosis in Lima

La mayoría de las nuevas especies de bartonellas se describieron desde de esta década, sin embargo de poca información se dispone aún en nuestro país. El presente fue un estudio prospectivo y descriptivo transversal, realizado entre enero y diciembre de 1998 en el Hospital Nacional Cayetano Heredia, Instituto de Salud del Niño y algunos consultorios privados de Lima, captando pacientes con sospecha de enfermedades causadas por nuevas especies de bartonellas. Se incluyeron 30 individuos con sospecha clínica de enfermedad de arañazo del gato, detectando por IFI B. henselae en ocho pacientes a títulos entre 1/50 y 1/200, y en un paciente B. clarridgeiae y B. henselae en títulos de 1/800, dos pacientes mostraron histopatología compatible. Cinco pacientes fueron incluidos con sospecha clínica de angiomatosis bacilar, dos con confirmación patológica y uno con títulos de 1/50 en IFI a B. henselae. No se logró preservar colonias por cultivo utilizando condiciones especiales. Se demuestra así, la existencia de B. henselae y B. claridgeiae como agentes causales de enfermedad de arañazo del gato, por IFI e histopatología, entre pacientes de edad pediátrica; y B. henselae en angiomatosis bacilar, constituyendo diagnóstico diferencial de Sarcoma de Kaposi y Verruga Peruana, en nuestro país.

Eficacia y tolerancia de cefepima en infecciones adquiridas en la comunidad / Effectiveness and tolerance of cefepima in infections acquired in the community

Se evaluó la eficacia y tolerancia de cefepima, una cefalosporina de cuarta generación, en infecciones adquiridas en la comunidad siguiendo un diseño abierto y no controlado en cuatro hospitales en Lima, Perú. Entre mayo y noviembre de 1997, se tuvo 31 pacientes: 10 con infecciones de la piel y tejidos blandos, 16 con infecciones del tracto urinario alto y 5 con neumonía lobar. Se obtuvo la cura clínica en todos los pacientes con infecciones del tracto urinario y neumonía lobar; y en 8 pacientes con infecciones de la piel y tejidos blandos. Todos los pacientes lograron cura bacteriológica. Cefepima fue bien tolerada. Concluimos que cefepima es una alternativa en el manejo de las infecciones adquiridas en la comunidad.

Rinoescleroma reporte de cinco casos clínicos / Rinoescleroma reports of five clinical cases

Se evaluaron cinco pacientes con un rango de edad de 25-60 años, tres de sexo femenino y 2 de sexo masculino, todos de condición socioeconómica baja, 3 de ellos naturales de provincias. El tiempo de enfermedad varió de 6 meses a 10 años, caracterizado por compromiso de vías aéreas superiores (obstrucción nasal, estridor laríngeo, tos y expectoración esporádica), historia previa de tratamiento antibióticos y otros medicamentos sintomáticos. El diagnóstico se baso en a:) examen otorrinolaringológico, evidenciando en todos los pacientes infiltrado granulomatoso con exudado, alteraciones de la estructura con obstrucción de luz en nasofaringe u orofaringe, b) Biopsia de lesión, todos los pacientes presentaron procesos granulomatoso crónico con células sugerentes de rinoescleroma. c) Cultivo de secreción, siendo positivo en 3/5 de los pacientes, se aisló Klebsiella sp, Klebsiella rhinoescleromatis y Klebsiella ozaenae, según la histria clínica dos pacientes recibieron tratamiento antibiótico previo, pudiendo haber negativizado el cultivo. Tres pacientes recibieron ciprofloxacino 500 mg dos veces por día por un tiempo de 4 a 12 semanas, un cuarto paciente recibió ciprofloxacina por siete meses y un paciente recibió tetraciclina 500 mg cuatro veces al día por 6 semanas. El seguimiento de 3 semanas a un año muestra evolución favorable, desaparición y mejoría de la sintomatología y negativización de los cultivos.